در همان سال ، فعالیت های وی در جلسه توجیهی طبقه بندی نشده توسط بازرس ارشد آژانس انرژی هسته ای فاش شد. بعداً مشخص شد که وی آنچه ایرانیان پروژه های 110 و 111 نامیدند را اجرا کرد – تلاشی برای مقابله با دشوارترین مشکلاتی که طراحان بمب با آن روبرو هستند زیرا آنها سعی می کنند کلاهکی را به اندازه کافی کوچک کنند تا در بالای موشک قرار بگیرد و باعث شود که از سختی های موجود زنده بماند – وارد جو شوید.
ایران با تأکید بر اینکه تولید مواد هسته ای صرفاً برای اهداف صلح آمیز بوده است ، همیشه منکر جستجوی سلاح هسته ای شده است. اما یک عملیات اسرائیلی در اوایل سال 2018 که یک انبار پر از اسناد ایرانی در مورد “پروژه آمد” را به سرقت برد ، چیزی که ایرانیان 20 سال پیش آن را تلاش برای سلاح هسته ای می نامیدند ، شامل اسنادی در مورد آقای فخری زاده و دخالت وی بود.
اندکی پس از آن ، بنیامین نتانیاهو نخست وزیر اسرائیل آقای فخری زاده را متمایز کرد در یک برنامه تلویزیونی ، هنگامی که او عملیات مخفی اسرائیل برای تصرف بایگانی را شرح داد. وی اتهاماتی را در مورد هدف تحقیقات هسته ای خود دروغ گفته بود و وی آقای فخری زاده را به عنوان رهبر برنامه آمد معرفی کرد.
مقامات اسرائیلی ، بعداً توسط مقامات اطلاعاتی آمریكا كه بایگانی را مورد بررسی قرار دادند ، مورد حمایت قرار گرفتند ، گفتند كه این دانشمند عناصر برنامه را حتی پس از آنكه ظاهراً كنار گذاشته شد ، زنده نگه داشته است. آقای نتانیاهو استدلال کرد که این کار اکنون به صورت مخفیانه انجام می شود ، توسط سازمانی در وزارت دفاع ایران معروف به SPND وی افزود: شما تعجب نخواهید کرد اگر بشنوید که SPND توسط همان شخصی هدایت می شود که پروژه آماد ، دکتر فخری زاده را رهبری می کند. “
آقای نتانیاهو افزود: “و همچنین ، به طور تصادفی ،” تصویری را نشان می دهد كه به نظر می رسد آقای فخری زاده است – فقط تعداد انگشت شماری از تصاویر منتشر شده از او وجود دارد – “بسیاری از پرسنل اصلی SPND زیر نظر فخری زاده در پروژه آمد کار می كردند “
قتل قطعاً واکنش شدیدی را در ایران به دنبال خواهد داشت.
قتل آقای فخری زاده ، هر کسی که مسئولیت آن را داشته باشد ، می تواند پیامدهای گسترده ای برای دولت ورودی بایدن داشته باشد. این کشور همانند حمله آمریکایی ها به 3 ژانویه که قاسم سلیمانی ، سردار ایرانی که نیروی نخبه قدس سپاه پاسداران انقلاب اسلامی را اداره می کرد ، منجر به واکنش شدید در ایران شد).
کشته شدن آقای فخری زاده می تواند تلاش رئیس جمهور منتخب جوزف آر. بایدن جونیور را برای احیای توافق هسته ای 2015 ایران ، همانطور که وی متعهد شده است انجام دهد ، در صورت توافق ایرانی ها برای بازگشت به محدودیت های مندرج در توافق ، پیچیده تر می کند.